Pluto Bio Reseñas y Detalles del Producto

Pluto me facilita organizar mis datos y realizar análisis bioinformáticos, sin tener que programar. Pluto también me permite crear buenas figuras representativas por mi cuenta. Me gusta que todos mis datos puedan guardarse en el mismo lugar y me da la flexibilidad de crear más gráficos e interpretaciones mientras analizo. También me gusta que tengan una función de chat receptiva que responde a mis consultas rápidamente. Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

Sería útil realizar más tipos de análisis estadísticos en Plutón. Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

Nuestro equipo tiene poco conocimiento sobre cómo analizar datos de transcriptoma utilizando lenguajes de programación complejos (R, Python). Pluto facilita que cualquiera de nosotros pueda ver nuestros propios datos y hacer gráficos de barras, gráficos de volcanes, etc. Frecuentemente vuelvo y creo nuevas figuras/análisis comparativos en mis conjuntos de datos más adelante cuando necesito un nuevo gráfico. Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

Me gustaría ver aún más tipos de análisis para elegir en Pluto. Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

Plutón es útil para compartir datos y visualización, particularmente para los ensayos biológicos 'simples' que hago. Puedo integrar múltiples ensayos en un solo lugar fácil, y agregar tanto imágenes como texto. Está basado en la nube, así que puedo trabajar en mis datos desde cualquier lugar, incluso desde mi teléfono (¡lo cual he hecho antes!). Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

La barrera para la usabilidad es bastante alta, no he podido incorporar a tantos colegas como me hubiera gustado.

Los gráficos no están listos para publicación: cuando los valores están por debajo de 1, no se muestran decimales. Las leyendas no son editables para mayor claridad y no pueden incluir unidades.

En el formato de Datos de Muestra, Pluto no puede extraer valores numéricos si se incluye texto. Esto hace imposible agregar 'objetivos' como concentraciones (5uM, por ejemplo).

No hay modelado de Bliss ni curvas de ajuste para IC50s. Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

Soy un investigador experimentado en bioinformática que ha probado personalmente numerosas plataformas de análisis y visualización en varios tipos de -ómicas. Una gran ventaja de esta plataforma es que es completamente de extremo a extremo. No he encontrado otra plataforma que pueda procesar archivos de secuenciación grandes, realizar control de calidad y generar análisis interpretables y de calidad para publicación.

He compartido datos a través de esta plataforma (lo cual es bastante fácil) con investigadores con experiencia limitada en bioinformática. A pesar de esa limitación, la plataforma es tan intuitiva que son fácilmente capaces de entender el análisis hasta ese punto y rápidamente capaces de generar nuevos análisis. Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

Los investigadores siempre quieren más características y análisis, así que me gustaría ver un crecimiento continuo. He usado esta plataforma durante más de un año y me ha impresionado el crecimiento y desarrollo continuos. Se añaden nuevos experimentos y análisis con frecuencia, manteniendo esta plataforma actualizada con lo que se necesita para el análisis bioinformático, pero se necesitará un desarrollo continuo.

Se realiza un control de calidad extenso. Sin embargo, debido a que se genera tanta información, puede ser difícil saber rápidamente si hay problemas con los datos. Las notificaciones de control de calidad podrían ser un área de mejora. Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

La parte más útil de Pluto es la sección de métodos que acompaña a cada figura. Fue muy fácil escribir el manuscrito cuando cada figura tiene exactamente lo que se hizo para crearla. Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

Realmente no hubo nada que no me gustara, lo único que me gustaría ver es más opciones para mostrar datos. Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

Pluto facilita la ejecución de las partes más mundanas del procesamiento del análisis NGS con muy poco tiempo de intervención del usuario. Como bioinformático, no disfruto ejecutar las partes básicas de los análisis informáticos (como el control de calidad y la generación de matrices de conteo), y Pluto me permite pasar un par de minutos subiendo los datos para que pueda centrarme en las partes más intrincadas de los análisis posteriores y en el desarrollo de software. Proporcionan métricas de control de calidad muy completas y exhaustivas, de modo que si necesito modificar o volver a ejecutar la tubería, puedo hacerlo fácilmente haciendo una copia del experimento, cambiando un par de parámetros y volviendo a ejecutar según los problemas de control de calidad que veo. Puedo hacer esto seriamente en menos de 5 minutos de mi tiempo. También creo que la capacidad de importar estudios GEO desde fastq hasta el análisis es muy poderosa y me ahorra mucho tiempo al intentar descargar fastqs y lidiar con problemas de ancho de banda de internet desde SRA y volver a analizarlos para que sean concordantes con las tuberías y parámetros que quiero usar; la plataforma hace que la ejecución de análisis reproducibles sea mucho más eficiente. Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

Me gustaría ver más tutoriales/documentación/videos sobre cómo interpretar diferentes partes del informe de multiqc y ejemplos de cuándo debería preocuparme por el control de calidad. Además, más tipos de experimentos serían geniales: algún tipo de pipeline simplificado para la llamada de variantes (particularmente para estudios de cáncer) o análisis de scRNA-seq estaría bien. Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

Es una plataforma amigable para científicos de laboratorio húmedo que reduce los pasos hacia el análisis real. ¡Y el personal de Pluto está disponible y es bastante receptivo para resolver problemas cuando sea necesario! Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

Se agradecerían más seminarios web considerando los diversos aspectos que se pueden explorar en la plataforma. Y si pueden reflejar la tecnología de célula única, que se está convirtiendo en un estándar, sería increíble. Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

Pluto permite la colaboración entre equipos. Es muy útil tener todos los datos relacionados con una muestra determinada visualizados en un solo lugar. Es una gran adición al software ELN, donde el enfoque está en los protocolos y el mantenimiento de registros en lugar de la visualización y la colaboración. Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

Al agregar nuevos datos a Pluto para repeticiones técnicas de experimentos, se necesita cargar un archivo completamente nuevo y rehacer los gráficos, lo cual toma un poco de tiempo extra.

Además, los decimales no se muestran en los gráficos en el eje y. Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

Tienda única para todas mis necesidades de secuenciación de ARN sin necesidad de ser bioinformático. Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

Nada realmente. Quizás al principio algunas cosas tenían errores, pero su equipo ha sido increíble en solucionarlos, así que ya no es un problema... Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

Me encanta lo fácil que es crear un gráfico a partir de datos de RNAseq masivo. Reseña recopilada por y alojada en G2.com.

Desearía que hubiera un botón de eliminar para los proyectos realizados por error en la interfaz de usuario. Reseña recopilada por y alojada en G2.com.